但是，在BIM+GIS的集成过程中，也面临着许多无法回避的困难。
1.BIM数据格式接入GIS平台
目前，BIM软件来自国内外不同的软件产商，有着不同的存储方式与数据格式，使得BIM数据接入有一定的挑战。
2.BIM模型轻量化
GIS地理信息系统需要处理一个区域或者城市的BIM模型及各种信息，多个大体量BIM模型的同时加载，会让GIS的终端产生卡顿甚至崩溃，BIM轻量化能减轻BIM模型及信息的加载压力。
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GIS表达室外环境，没有室内模型信息，而BIM可以为GIS提供室内模型信息。因此，要想集成GIS场景与BIM模型完整的数据，首先要解决在GIS平台表示BIM模型的难题。
4.三维数据坐标转换
BIM与GIS有各自的坐标系，BIM采用的是独立的坐标系统，而GIS由于采集方式众多，所使用的坐标存在差异，这导致两者坐标无法匹配。
……
上述列举的只是BIM+GIS集成过程中遇到的部分问题，如何解决这些问题，研发出适应市场需求的BIM+GIS管理平台，才是问题的关键。
为了让BIM+GIS管理平台适应行业发展与工程项目各参与方的使用需求，平台应当要实现以下目标：
项目各参与方基于同一套信息模型和一个信息化管理平台实现数据和信息的交流和共享：
设计方负责工程设计信息模型及变更信息等基础数据的上传；
施工单位和监理方负责对施工进度、质量、安全、计量等业务数据和资料的上报、检查和审核；
业主基于管理平台进行数据查看、流程审批、决策等工作。
平台内包含了模型、数据，内嵌了业务管理流程，包含协同办公、数字化交付、进度管理、质量管理、计量管理、安全管理和档案管理共7个主要的功能模块。
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